高壓蒸汽滅菌器是醫療安全的一個重要環節，也是控制傳染性疾病蔓延的一個關鍵措施，脈動真空蒸汽滅菌器是目前醫院應用普遍而有效的醫療器械滅菌方法，該實驗室儀器的工作原理是通過多次對滅菌室抽取真空和充入蒸汽，使滅菌室達到一定的真空度后，讓滅菌器內部無殘留的空氣，再充入飽和蒸汽，達到設定壓力和溫度，利用蒸汽在凝結成水的過程中釋放的潛熱殺滅細菌，實現對被滅菌物進行滅菌的目的。
高壓蒸汽滅菌器對冷空氣排出比較*，一般脈動三次，每次脈動-80Kpa以下，從而使滅菌室內排出冷空氣達到99%以上，滅菌室內溫度一致性高，內室抽空，夾層保持一定壓力溫度，還能使滅菌物品干燥，避免二次感染。
高壓蒸汽滅菌器滅菌程序運行過程如下： 脈動——升溫——滅菌——排汽——干燥——結束。
1、脈動：對滅菌器內室進行抽真空、進蒸汽操作，反復進行三次，然后再次抽真空，待內室壓力到達脈動下限后，程序轉入升溫階段。經過該階段后，內室的冷空氣排除率可達到99%以上，確保內室無死點，保證滅菌的合格。
2、升溫：蒸汽經過滅菌器夾層進入內室，對器械進行加熱，同時內室疏水閥間歇性開啟，將蒸汽冷凝后產生的水排出。內室溫度達到設定值后程序轉入滅菌階段。
3、滅菌：開始滅菌計時，在此期間內室進汽閥受到內室溫度和壓力的共同控制以確保內室保持在一定的溫度范圍內對器械進行滅菌。當內室溫度高于滅菌器設定的數值上*，進汽閥關閉，低于數值下*，進汽閥打開；同時，當內室壓力高于數值上*，進汽閥也會關閉，低于內室壓力下限值時，進汽閥打開以確保滅菌階段溫度的上下波動不超過3°。滅菌計時結束后，程序轉入排汽階段。
4、排汽：排汽閥打開，內室的蒸汽在內外壓差的作用下排出，經過換熱器的作用，大部分蒸汽冷凝成水，少部分蒸汽經過濾后排至大氣。內室壓力下降到設定值后，程序轉入干燥階段。
5、干燥：真空泵打開對內室進行抽真空，同時夾層保持一定的壓力和溫度，起到烘干器械的作用。
6、結束：蜂鳴器呼叫，此時可以打開門將滅菌車推出進行器械的晾放。
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